基于生物信息学与孟德尔随机化探索组织蛋白酶在结直肠癌诊治中的应用
郭东琪1
张平2
王源2
张静茹2
白建琦2
苏红梅2
郭宵飞2
1.100105 北京,北京中医药大学研究生院;100102 北京,中国中医科学院望京医院病理科2.100102 北京,中国中医科学院望京医院病理科
摘要：目的 综合采用生物信息学和孟德尔随机化的方法探索组织蛋白酶作为结直肠癌诊断标志物和药物靶点的潜力.方法 从TCGA数据库获取结直肠癌转录组数据进行生物信息学分析,分析组织蛋白酶在结直肠癌中的表达情况,判断其是否是结直肠癌潜在的诊断标志物;从IEU OpenGWAS数据库中获取9种组织蛋白酶(组织蛋白酶B、E、F、G、H、L2、O、S及Z)的GWAS数据,从FinnGen数据库获取结直肠癌的GWAS数据进行孟德尔随机化分析,评估组织蛋白酶与结直肠癌间的因果关系,判断其作为药物靶点的潜力.结果 组织蛋白酶F、G、O在结直肠癌肿瘤组织较癌旁正常组织低表达,其余6种组织蛋白酶在结直肠癌肿瘤组织较癌旁正常组织高表达(P<0.001);除组织蛋白酶E、O外的7种组织组织蛋白酶ROC曲线下面积﹥0.7,其中组织蛋白酶H、L2 ROC曲线下面积﹥0.9;组织蛋白酶H水平与结直肠癌呈负相关(逆方差加权法:OR=0.95,95％CI:0.92～0.99,P<0.01),未发现其它组织蛋白酶与结直肠癌的因果关系(P>0.05).结论 组织蛋白酶H、L2对结直肠癌有良好的诊断效能,是结直肠癌潜在的诊断标志物;组织蛋白酶H浓度可能降低结直肠癌的风险,是结直肠癌潜在的治疗靶点.
关键词：组织蛋白酶结直肠癌生物信息学孟德尔随机化
分类号：R735.3+5(消化系肿瘤)
资助基金：国家自然科学基金(82174415)中国中医科学院创新工程重大攻关项目(C12021A05054)中国中医科学院望京医院高水平医院建设循证研究重点专项(WJYY-XZKT-2023-07)
论文发表日期：2024-07-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 933-938 )
英文信息