结直肠腺瘤的加权基因共表达网络构建与分析
高亚东
屈亚威
刘海峰
1.解放军总医院第三医学中心消化内科, 北京,1000392.解放军总医院第三医学中心消化内科, 北京,1000393.解放军总医院第三医学中心消化内科, 北京,100039
摘要：目的 利用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)方法探究结直肠腺瘤(colorectal adenoma,CRA)潜在的分子机制.方法 采用WGCNA构建CRA的基因共表达网络并识别共表达模块,通过功能富集分析了解这些模块中基因的生物学功能,并筛选出与样本上皮内瘤变级别密切相关的枢纽基因.结果 本文鉴别出15个共表达模块.这些模块中基因分别在乏氧应答、骨形态生成蛋白信号通路负性调节、脂质代谢等过程显著富集.此外本研究获得8个与上皮内瘤变级别相关的模块,并在相关性最高的模块中识别出了11个枢纽基因.结论 通过WGCNA识别出一些与结直肠腺瘤相关的模块(其中淡绿色模块相关性最高)和枢纽基因(包括ACBD7、GAGE7、ZNF713、HPX-2、WIPF3、GBP6、GNG13、PAX4、REXO1L1、POTEG、JAKMIP3),这些模块及基因为进一步了解结直肠腺瘤的发生发展机制提供了新的线索.
关键词：结直肠腺瘤加权基因共表达网络分析上皮内瘤变模块
分类号：R735(消化系肿瘤)
资助基金：国家自然科学基金(81471700)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 31-36 )
英文信息