miR-197在慢性心力衰竭中的生物信息学分析
王庆高1
何亚州2
李丽娟2
黄彩依2
黄景伟2
梁珊2
1.广西中医药大学第一附属医院 南宁 5300232.广西中医药大学研究生院
摘要：目的 筛选在慢性心力衰竭中差异表达的microRNA(miRNA),并对其靶基因进行生物信息学分析,以期为miRNA调控慢性心力衰竭机制的相关性研究奠定基础.方法 利用GEO数据库及limma软件包筛选出在慢性心力衰竭中差异表达的miRNA,进而应用Targetscan、miRPathDB数据库通过生物信息学方法预测其靶基因,最后利用CytoScape软件及David数据库对靶基因进行GO富集及生物通路富集分析.结果 miR-197在慢性心力衰竭中差异表达,其靶基因富集在生物调控、基因表达等生物学过程中,细胞质膜、细胞核等细胞组分上,以及离子结合、核苷酸结合等分子功能中.生物信号通路则显著富集在Ras、Rap1、Wnt、Hippo等信号通路中.结论 miR-197或许是调控慢性心力衰竭疾病进程的潜在作用靶点.
关键词：慢性心力衰竭miRNAmiR-197生物信息学分析靶基因GEO数据库
分类号：R541.6(心脏、血管（循环系）疾病)R256.2(中医内科学)
资助基金：国家自然科学基金(No.81160437)广西自然科学基金(No.2013GXNSFAA019200)广西壮族自治区高等学校项目(No.J14036)
论文发表日期：2020-03-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 723-728 )