癫痫发作的新皮质中差异表达基因生物信息分析
彭金香1
吴沣2
1.湖北恩施学院 湖北恩施 4450002.恩施土家族苗族自治州中心医院 湖北恩施 445000
摘要：目的 对尼古丁诱导癫痫发作新皮质中发现的差异表达基因(DEGs)进行生物信息学分析.方法 利用DAVID 6.8和STRING 11.0等分析平台对基因芯片公共数据库(GEO)发表的尼古丁诱导癫痫发作的新皮质筛选DEGs,并进行基因本体(GO)功能富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析和蛋白质相互作用网络构建.结果 癫痫发作新皮质中发现的DEGs与癫痫致病性基因构建网络,结果共筛选出95个上调基因及119个下调基因,DEGs主要富集于胞嘧啶上的DNA甲基化、DNA复制偶联的核小体组装、细胞凋亡过程的调控等生物学过程,以及刺激神经组织的配体受体相互作用通路、核转录因子(NF-κB)信号通路等.结论 尼古丁诱导癫痫发作新皮质相比正常新皮质的DEGs存在明显差异.多个信号通路、多个蛋白质相互作用方式为理解癫痫发作新皮质病理过程提供了帮助.
关键词：癫痫新皮质差异表达基因生物信息学富集分析
资助基金：教育厅科学研究计划指导性项目(No.B2018430)
论文发表日期：2021-07-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 2163-2167 )
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