基于生物信息学筛选急性心肌梗死后心力衰竭差异表达基因及潜在干预中药
乔利杰1
王建茹2
李彬2
朱明军2
1.河南中医药大学 郑州 4500002.河南中医药大学第一附属医院 郑州 450000
摘要：目的:利用生物信息学技术分析急性心肌梗死后心力衰竭(HFpAMI)的差异表达基因(DEGs),并对干预 DEGs的中药进行预测,为深入探索 HFpAMI 相关作用机制及干预中药的用药规律提供科学依据.方法:从基因表达综合数据库(GEO)中获取GSE59867数据集中有关急性心肌梗死后的心力衰竭(HF)和非心力衰竭样本;利用 Limma包筛选两组样本间的 DEGs,通过基于本体的医学信息检索平台(Coremine Medical)数据库预测干预 DEGs的中药,收集其性味归经及功效等信息.利用 WGCNA获取与临床性状相关性最高的基因模块,再与 DEGs取交集后获得次 Hub基因,构建次 Hub基因的蛋白互作网络并进行模块分析,筛选Hub基因,并对单个 Hub基因进行基因集富集分析(GSEA).结果:共鉴定出 140 个 DEGs和 10 个 Hub基因,10 个 Hub基因为分化抗原 28(CD28)、原癌基因 c-Fos(FOS)、白细胞介素-2 受体α亚型(IL2RA)、B淋巴细胞抗原 CD20(MS4A1)、Rho相关 GTP结合蛋白(RHOH)、分化抗原 24(CD24)、假定 P2Y嘌呤受体 10(P2RY10)、二肽基肽酶 4(DPP4)、血小板反应蛋白-1(THBS1)、2 型补体受体(CR2).GSEA共发现 19条信号通路,涉及免疫损伤和炎症介导的多个生物学过程及信号通路,其中以补体及凝血级联最为关键.中药预测结果显示:潜在干预 HFpAMI的中药药性多为性温、性寒,药味以苦、甘多见,多归为肝、脾、肺经,以补虚药、清热药、活血化瘀药为主.结论:本研究挖掘出 HFpAMI 10个潜在关键基因,同时,还发现与干预 HFpAMI相关的中药大多归肝、脾、肺经,性味多为温、寒、苦、甘,功效多为补虚、清热、活血化瘀.在一定程度上为中医临床遣方用药治疗 HFpAMI以及进一步开展探索性实验研究提供了借鉴和思路.
关键词：急性心肌梗死心力衰竭生物信息学差异表达基因中药
资助基金：国家自然科学基金(No.82004311)河南省科技攻关项目(No.202102310492)河南省博士后科研项目(No.202001045)河南省中医药科学研究专项课题(No.2019JDZX2013)河南省中医药科学研究专项课题(20-21ZY2187)
论文发表日期：2023-09-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：11( 3117-3127 )
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