基于网络药理学和分子对接技术探讨蔓荆子防治急性心肌梗死的作用机制
陈礼琴1
徐彤彤1
吕祥威2
武琦3
覃秋语1
赵位昆1
1.桂林医学院附属医院(广西桂林 541001)2.桂林医学院(广西桂林 541199)3.徐州医科大学
摘要:目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨蔓荆子防治急性心肌梗死(AMI)的作用机制.方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对蔓荆子的有效成分及作用靶点进行筛选,通过 SwissTargetPrediction平台进行补充;利用 UniPort数据库注释靶点基因;通过 GeneCards、DisGeNET、TTD、OMIM数据库获取 AMI的疾病靶点;将药物靶点与疾病靶点取交集,采用 Cytoscape 3.9.1软件构建"药物-药物化合物-靶点"可视化网络图;应用 Rstudio 4.1.3通过 Bioconductor数据库对交集靶点进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过 STRING 数据库对交集靶点进行蛋白相互作用(PPI)分析,利用Cytoscape 3.9.1软件 CytoHubba插件对 PPI网络进行分析,获得关键靶点.通过 AutoDock Tools 1.5.7 软件和 Pymol 2.4.0 对部分关键靶点蛋白受体和化合物配体进行分子对接验证和可视化分析.结果:筛选得到蔓荆子中的活性成分共计 27 个,药物与疾病交集靶点 185个;通过蔓荆子-药物化合物-靶点网络模型发现其防治 AMI的主要活性成分为槲皮素、木犀草素、山柰酚、豆甾醇、牡荆素 C;GO分析显示主要与调节脂多糖应答的生物过程相关,KEGG通路富集分析显示主要作用机制可能与脂质和动脉粥样硬化、糖尿病并发症受体信号通路、血流剪切应力与动脉粥样硬化、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号转导通路有关.结论:蔓荆子对 AMI的干预作用具有多成分、多靶点、多通路、多环节的调控特点,可能通过调节脂代谢、抗炎、免疫调节、促进血管生成以及调节细胞自噬等过程发挥治疗作用.
关键词:急性心肌梗死蔓荆子网络药理学分子对接
资助基金:国家自然科学基金(No.82260864)广西自然科学基金项目(No.2020GXNSFAA297009)
论文发表日期:2023-11-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:12( 3863-3874 )
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中西医结合心脑血管病杂志

中西医结合心脑血管病杂志

CSTPCD
ISSN:1672-1349
年,卷(期):2023,21(21)
所属栏目:临床医学论著