冠心病进展相关基因筛选及冠心Ⅱ号方干预靶点的预测
骆金文1
刘敏2
于燕乔2
谭宇1
史大卓1
马晓娟3
1.中国中医科学院西苑医院心血管病研究中心(北京 100091)2.北京中医药大学临床医学院西苑医院3.中国中医科学院西苑医院心血管病研究中心(北京 100091);中国中医科学院西苑医院中医药保健研究中心(北京 100091)
摘要：目的:探索冠心病疾病进展相关基因,并预测冠心Ⅱ号方防治冠心病的作用靶点.方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载急性心肌梗死(AMI)与稳定型冠心病(SCAD)病人转录组表达谱,通过差异表达分析和加权基因共表达网络分析(WGCNA),筛选冠心病疾病进展相关基因,并针对冠心病进展相关基因进行基因本体(GO)功能分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库下载冠心Ⅱ号方的有效成分及药效靶点,与冠心病疾病进展相关基因进行交集分析,获得冠心Ⅱ号方防治冠心病的潜在靶点.结果:通过差异表达分析比较 AMI和 SCAD转录组表达谱,共获得 166 个差异表达基因(DEGs).通过 WGCNA获得与 AMI相关的基因模块 Black.取 DEGs与 Black模块的交集,获得 64个冠心病疾病进展相关基因.从 TCMSP数据库共获得 224个冠心Ⅱ号方的药效靶点,将药效靶点与冠心病疾病进展相关基因取交集,得到冠心Ⅱ号方防治冠心病的潜在作用靶点,即过氧化物酶体增殖物激活受体(PPARG)、单核细胞分化抗原CD14(CD14)和细胞色素P4501b1(CYP1B1).结论:细胞因子信号转导抑制因子 3(SOCS3)、嗜酸性粒细胞阳离子相关蛋白(ECRP)、肿瘤坏死因子受体超家族成员10D(TNFRSF10D)、S100钙结蛋白 A9(S100A9)等 64个基因可能与冠心病疾病进展相关,其中,PPARG、CD14、CYP1B1 是冠心Ⅱ号方防治冠心病的潜在作用靶点.
关键词：急性心肌梗死稳定型冠心病冠心Ⅱ号方转录组干预靶点基因筛选
资助基金：国家自然科学基金(No.82174214)国家自然科学基金(82074418)
论文发表日期：2024-02-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 393-401 )
英文信息