基于网络药理学及分子对接探讨益气活血方治疗冠心病的作用机制
王琨1
杨传华2
杨洁2
1.山东中医药大学(济南 250011)2.山东中医药大学附属医院(济南 250011)
摘要:目的:通过网络药理学方法分析益气活血方治疗冠心病的分子作用机制,并通过分子对接进行验证.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中药分子机制的生物信息学分析工具数据库(BATMAN-TCM)进行检索并筛选出益气活血方中的药物活性成分及作用靶点;在人类基因名片数据库(GeneCards)、人类孟德尔遗传在线数据库(OMIM)、药品数据与药物靶点数据库(DrugBank)、治疗靶点数据库(TTD)检索冠心病对应疾病靶点;通过 R语言"Venn"插件得到药物有效活性成分和冠心病的共同靶点基因,应用 STRING数据库,获得蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,利用Cytoscape 3.7.2软件中CytoNCA插件筛选候选核心靶点基因,并逆向获得相关有效成分;共同靶点通过 R语言"ClusterProfile"等插件,完成基因本体(GO)与京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;Cytoscape 3.7.2软件绘制成分-靶点-通路,根据节点筛选核心靶点及成分;利用 AutodockTool 4软件对所筛选的核心靶点及成分进行分子对接.结果:筛选得到益气活血方 113个主要有效成分,经分子对接验证后,得到治疗冠心病的核心靶点有热休克蛋白 90α家族 A类成员 1(HSP90AA1)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 B1(AKT1)、雌激素受体 1(ESR1)、核因子κB P65(RELA)和半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(CASP3),核心成分有槲皮素、山柰酚、木犀草素、异鼠李素和柚皮素.结论:益气活血方中的槲皮素、山柰酚、木犀草素、异鼠李素和柚皮素等有效化学成分,可能通过作用于 HSP90AA1、AKT1、ESR1、RELA和 CASP3 等关键靶点,调节脂质和动脉粥样硬化、流体剪切应力和动脉粥样硬化、晚期糖基化终末产物(AGE)/糖基化终末产物受体(RAGE)信号通路、前列腺癌和白细胞介素(IL)-17信号传导途径等多条信号通路,发挥治疗冠心病的作用.
关键词:冠心病益气活血方网络药理学分子对接作用机制
资助基金:国家自然科学基金(No.82374385)泰山学者青年专家(No.tsqn202211352)
论文发表日期:2024-07-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:10( 2312-2321 )
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