基于网络药理学结合分子动力学模拟技术探讨愈梗通瘀汤治疗心绞痛的作用机制
黄希1
黄静静1
张硕1
江红梅1
吴黎明2
张文强3
郑坤森3
曾婧仪3
梁健4
连大卫5
1.福建中医药大学附属第三人民医院 福州 3501082.福建医科大学附属协和医院3.福建中医药大学中西医结合研究院 福州 3501084.东莞广州中医药大学研究院 广东东莞 5231065.福建中医药大学附属第三人民医院 福州 350108;福建中医药大学中西医结合研究院 福州 350108;东莞广州中医药大学研究院 广东东莞 523106
摘要：目的:通过网络药理学、分子对接和分子动力学模拟技术,探讨愈梗通瘀汤治疗心绞痛的作用机制,通过体外实验进行验证.方法:通过查询TCMSP和TCMIP中药成分数据库,筛选愈梗通瘀汤的化学成分及相应的蛋白靶点,进一步通过UniProt数据库查询基因名称.根据数据库查询结果,构建"中药-有效成分-靶点"相互作用网络.同时,通过GeneCards和OMIM疾病靶点数据库筛选与心绞痛的疾病相关靶点,将愈梗通瘀汤的作用靶点与心绞痛疾病相关靶点取交集,获得两者的共同靶点.随后利用Cytoscape与STRING数据库分别构建了"活性成分-潜在作用靶点"及"药物-靶点-基因本体(GO)/京都基因与基因组百科全书(KEGG)"网络关系图.使用AutoDock Vina进行分子对接验证,利用OpenMM软件对分子对接后的蛋白-配体体系进行模拟验证,最后通过体外细胞实验进行了验证.结果:共筛选获得了265种活性成分及671个潜在作用靶点;进一步筛选出了182条信号通路;GO富集分析表明,主要涉及炎症反应、组织修复、氧化应激反应等;KEGG富集分析表明,主要涉及动脉粥样硬化、糖尿病并发症以及非酒精性脂肪性肝病等相关通路;分子对接结果显示,10对关键活性成分和核心靶点最小结合能均<-5.0 kJ/mol,同时小于靶点原配体的结合能,提示对接效果良好;分子动力学模拟中展示人参皂苷Rh2与磷脂酰肌醇-3-激酶催化亚单位α(PIK3CA)具有良好的结合稳定性和活性;体外细胞实验表明,人参皂苷Rh2具有明显的心肌保护作用,同时激活磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-蛋白激酶B(AKT)通路.结论:通过网络药理学预测愈梗通瘀汤可能通过槲皮素、木犀草素、山柰酚、异黄酮、黄芩素、隐丹参酮、芦荟大黄素、人参皂苷Rh2、金黄紫堇碱、延胡索单酚碱等关键活性成分,调控低氧诱导因子-1(HIF-1)、肿瘤坏死因子(TNF)、PIK3CA、雌激素受体1(ESR1)等潜在通路靶点,这些通路与代谢性疾病中的炎症及氧化应激关系最为密切;且通过分子对接及分子动力学模拟和细胞实验表明人参皂苷Rh2的药理作用与激活PIK3-AKT通路关系密切;预测结果提示抗炎作用可能是愈梗通瘀汤治疗心绞痛的潜在作用机制之一.
关键词：心绞痛愈梗通瘀汤网络药理学分子对接分子动力学模拟
资助基金：国家自然科学基金(No.82204662)中西医结合基础福建省高校重点实验室开放课题(No.CKJ2022017)福建省自然科学基金项目(No.2023J01886)福建中医药大学校管科研课题(No.XB2021039)广东省基础与应用基础研究基金项目(No.2021B1515140050)全国大学生创新创业训练计划项目(No.202310393007)
论文发表日期：2024-12-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：11( 4274-4284 )
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