基于单细胞测序探索靶向microRNA-33治疗对动脉粥样硬化免疫微环境的影响
任亚娟
边云飞
杨慧宇
山西医科大学第二医院(太原 030001)
摘要：目的:基于单细胞测序探索靶向microRNA-33治疗对动脉粥样硬化(AS)免疫微环境的影响.方法:于基因表达综合数据库(GEO)下载单细胞RNA测序数据集GSE161494,根据治疗方式分为抗microRNA-33治疗组与对照组,使用R语言及相关软件包进行后续的生物信息学分析.利用"Monocle 2"包进行不同细胞亚群的拟时序演化轨迹分析,使用"cellchat"包进行细胞间通讯分析,表征细胞间通信网络.结果:经数据清洗、降维及聚类,共鉴定出10个细胞亚群,其中包含3个巨噬细胞亚群(4 171个细胞),3个T细胞亚群(4 139个细胞),1个自然杀伤(NK)细胞亚群(2 158个细胞),2个B细胞亚群(1 007个细胞)以及1个树突状细胞亚群(74个细胞).抗 microRNA-33组内"Macrophages_1"显著减少,"T-cells_1"占比则显著增高."Dendritic cells"亚群和"Macrophages_1"是细胞间通讯信号的主要输出者.结论:抗microRNA-33后动脉粥样硬化斑块免疫微环境中细胞亚群发生了显著改变,淀粉样前体蛋白(APP)信号通路可能在动脉粥样硬化中发挥了重要作用.通过单细胞层面评估microRNA-33对动脉粥样硬化斑块内巨噬细胞及免疫细胞的影响,有助于更好地理解其作用机制,为microRNA-33靶向治疗提供理论基础.
关键词：动脉粥样硬化单细胞RNA测序非编码RNA巨噬细胞细胞间通讯
资助基金：国家自然科学基金(No.82070472)
论文发表日期：2025-03-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：12( 657-668 )
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