基于网络药理学和分子对接探讨穿心莲改善心肌缺血再灌注损伤的潜在作用机制
赵位昆1
徐彤彤1
吕祥威2
陈礼琴1
徐子豪1
莫文月1
卢钰芬1
李月嫦1
1.桂林医科大学第一附属医院(广西桂林 541001)2.桂林医科大学(广西桂林 541199)
摘要：目的:运用网络药理学和分子对接技术探讨穿心莲改善心肌缺血再灌注损伤(MIRI)的潜在作用靶点及机制.方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出穿心莲的有效成分和作用靶点,采用UniPort数据库注释靶点基因;利用人类基因数据库(GeneCards)、DisGeNET、治疗靶点数据库(TTD)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获得MIRI的靶点;运用Venn在线软件获取穿心莲与MIRI的共同靶点基因,并以Venn图展示;采用Cytoscape 3.9.1软件构建"药物-药物有效成分-靶点"可视化网络图;应用注释、可视化和综合发现数据库(DAVID)对交集靶点进行基因本体(GO)及京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析;通过STRING数据库将交集靶点进行蛋白-蛋白相互作用(PPI)分析,利用Cytoscape 3.9.1软件Cytohubba插件对PPI网络进行分析,获取关键靶点.通过AutoDock Tools 1.5.7软件与PyMol 2.5.0对筛选后的6个关键靶点蛋白受体和药物活性成分配体进行分子对接验证.结果:筛选得到穿心莲的36个有效活性成分和172个靶点基因,MIRI相关靶点基因1 466个,49个药物与疾病交集靶点;获得关键核心靶点有α-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL6)、半胱天冬氨酸蛋白酶-3(CASP3)、一氧化氮合酶(NOS3)、细胞肿瘤抗原p53(TP53),其主要参与一氧化氮生物合成、脂多糖介导的信号传导、凋亡、基因表达、炎症反应等生物学过程;KEGG通路富集分析显示主要作用机制可能与脂质和动脉粥样硬化、磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(AKT)信号通路、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物(AGE)-晚期糖基化终末产物受体(RAGE)信号通路、EB病毒感染和白细胞介素(IL)-17信号通路等有关.结论:穿心莲对MIRI的干预作用具有多成分、多靶点、多通路、多环节的调控特点,其调控靶点可能主要涉及AKT1、TNF、IL6、CASP3、NOS3和TP53等;其调控的通路可能涉及氧化应激和炎症相关信号通路、细胞生存和凋亡相关信号通路等,这为后续深入探讨穿心莲改善MIRI的潜在分子作用机制奠定了基础.
关键词：心肌缺血再灌注损伤穿心莲网络药理学分子对接作用机制
资助基金：国家自然科学基金(No.82260864)广西壮族自治区中医药管理局自筹经费科研课题(No.GXZYC20240401)广西自然科学基金项目(No.2025GXNSFAA069850)广西壮族自治区研究生教育创新计划项目(No.YCSW2023412)
论文发表日期：2025-07-10
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：16( 1934-1949 )
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