基于加权基因共表达网络分析筛选动脉粥样硬化铁死亡相关Hub基因
王苗茜1
马明峰2
1.山西医科大学汾阳学院(山西 吕梁 032200)2.山西省汾阳医院/山西医科大学附属汾阳医院(山西 吕梁 032200)
摘要：目的:使用生物信息学分析鉴定动脉粥样硬化(AS)中缺氧和铁死亡相关差异基因.方法:对GSE12288、GSE97210和GSE28829进行生物信息学分析.采用"limma"软件包鉴定差异表达基因(DEG).进行不同种类的富集分析,以找出相关的途径.采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)构建共表达网络,以探索标记相关性并识别与AS相关的重要相互作用基因模块.Cytoscape用于可视化铁死亡相关基因和一些非编码RNA相互作用网络.采用CIBROSORT评估免疫细胞的丰度,揭示AS中免疫反应的影响.结果:共获得 30个铁死亡相关的差异表达基因,如铁蛋白轻链(FTL)、谷氨酸受体基因 3(GRIA3)、Prominin家族成员 2(PROM2)、白介素 1β(IL1B)等.基因本体(GO)和GSEA分析发现,上皮细胞增殖调控、膜筏和血管内皮生长因子(VEGF)通路等途径在AS中富集,然后进行调节网络和免疫细胞浸润丰度分析,以评估AS的潜在机制.结论:在AS中发现 30个与铁死亡相关的DEG,并与疾病的病理进展相关,且是未来潜在的治疗靶点,然而其潜在的发病机制和潜在的分子靶点仍需要更全面深入的研究.
关键词：动脉粥样硬化铁死亡Hub基因基因共表达生物信息学分析
资助基金：山西省中医药管理局科研项目(No.2023ZYYB083)
论文发表日期：2025-08-25
在线出版日期：2025-09-10（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：14( 2411-2424 )
英文信息