基于DNA甲基化差异性探讨太阴型脑梗死病人表观遗传学特征
刘向哲1
王晓丽2
路永坤1
杨海燕1
周红霞1
王新志1
1.河南中医药大学第一附属医院(郑州 450000)2.新密市中医院
摘要:目的:初步探索太阴型脑梗死病人DNA甲基化差异性及其表观遗传学特征,为脑梗死的精准防治提供理论依据.方法:根据中医"五态人"理论,按照《五态性格测验表(成人简版)》,选取太阴型脑梗死病人为研究对象,并选取阴阳平和型病人作为对照.采集相应的全血标本-80℃保存.采用Illumina 850K DNA甲基化芯片测序法,测定基因差异甲基化位点,并通过差异显著性、基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)注释筛选出与差异性相关的候选基因.结果:通过Illumina 850K芯片检测分析,共得到太阴型病人与阴阳平和型病人346个差异位点对应189个基因,其中,有175个低甲基化位点,171个高甲基化位点;高甲基化位点基因有101个,低甲基化位点基因有94个;其中,胆碱激酶β-肉碱棕榈酰转移酶1B(CHKB-CPT1B)、LOC101927502、序列相似性家族66成员D(FAM66D)、微管蛋白折叠辅助因子(TBCD)、生长分化因子7(GDF7)、受体型蛋白酪氨酸磷酸酶(N2PTPRN2)、银屑病易感1候选基因1(PSORS1C1)、22号染色体开放阅读框34(C22orf34)、钾电压门控通道亚家族E成员1(KCNE1)、序列相似性家族71成员F1(FAM71F1)、DNA聚合酶催化亚基(POLE)、磷脂酰肌醇聚糖锚定生物合成G类(PIGG)、钾钙激活通道亚家族M成员1(KCNMA1)、LOC285830、低氧诱导因子3α(HIF3A)同时具有多个差异甲基化位点.并对GO分析注释的前25个高甲基化水平基因和前25个低甲基化水平基因,根据Delta_Beta绝对值的大小进行了排序.在以上50个差异甲基化基因中位于启动子区的低甲基化基因有嗅觉受体家族8亚家族A成员1(OR8A1)、嗅觉受体家族2亚家族A成员5(OR2A5),高甲基化基因有肿瘤蛋白P53(TP73)、核孔蛋白35(NUP35)、跨膜蛋白9(TMEM9)、CLPTM1跨膜蛋白(CLPTM1)、复合素2(CPLX2)、血管紧张素转换酶(ACE)、β-1,3-半乳糖基转移酶1(B3GALT1).结论:太阴型脑梗死病人与阴阳平和型脑梗死病人全血DNA甲基化水平有明显差异,这些差异可能是两者发病率不同的原因.两者差异甲基化位点的基因大多与营养素的代谢、离子转运、炎症及免疫反应、神经递质分泌、信号传导、调控基因转录表达等方面相关,这些差异甲基化位点基因可能为太阴型脑梗死病人发病的内在危险因素.
关键词:脑梗死太阴型DNA甲基化表观遗传学
资助基金:河南省双一流创建学科中医学科学研究专项课题(No.HSRP-DFCTCM-2023-2-18)
论文发表日期:2025-08-25
在线出版日期:2025-09-10(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 2444-2450 )
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