基于转录组测序和RT-qPCR技术的烟草糖酯合成基因挖掘
黄申1
闫茗熠2
陈梦月1
尚紫博1
杨晨1
张金林3
褚智国3
毛多斌1
1.郑州轻工业大学烟草科学与工程学院,河南郑州 4500012.郑州轻工业大学烟草科学与工程学院,河南郑州 450001;山东中烟工业有限责任公司济南卷烟厂,山东济南 2500003.山东中烟工业有限责任公司技术中心,山东济南 250000
摘要:为挖掘调控烟草糖酯合成的功能基因,采用转录组测序对烟草腺毛细胞和叶细胞的差异表达基因及其功能进行分析,并利用RT-qPCR对分析结果进行验证.结果表明:共获得11 962个腺毛细胞和叶细胞的差异表达基因,其中5145个上调表达基因,6817个下调表达基因;上调表达基因主要包括生物学进程(2265个)、分子功能(1169个)、细胞成分(363个)3大类,可将基因序列定位到122条代谢通路中,其中与糖酯合成相关的糖酵解/糖异生、淀粉和蔗糖代谢、苯丙烷类生物合成被高度富集,腺毛细胞中酰基糖通路显著上调,有12个基因在功能上与酰基转移酶有关;在腺毛细胞中,分析得到的12个基因中有11个基因的表达量都高于叶细胞,其中gene63826、gene16194和gene37511表达分别上调195.79倍、166.23倍和132.65倍.上述11个基因可能参与调控腺毛细胞合成糖酯,为下一步验证基因功能提供依据.
关键词:烟草糖酯腺毛细胞转录组差异表达基因RT-qPCR
分类号:TS41+3(烟草工业)
资助基金:中国烟草总公司科技重点研发项目(110202002001)中国烟草总公司科技重点研发项目(110202202006)
论文发表日期:2023-12-15
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:8( 78-84,117 )
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轻工学报

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北大核心
ISSN:2096-1553
年,卷(期):2023,38(6)
所属栏目:烟草生物技术