1例输入性HIV-1 G亚型毒株的检出及基因组序列分析
杜波
李贺
罗周正
马玉霞
刘文新
赵地
吴莹
郭勇
田晓东
1.123000,阜新市卫生健康服务中心(阜新市疾病预防控制中心)2.123000,阜新市卫生健康服务中心(阜新市疾病预防控制中心)3.123000,阜新市卫生健康服务中心(阜新市疾病预防控制中心)4.123000,阜新市卫生健康服务中心(阜新市疾病预防控制中心)5.123000,阜新市卫生健康服务中心(阜新市疾病预防控制中心)6.123000,阜新市卫生健康服务中心(阜新市疾病预防控制中心)7.123000,阜新市卫生健康服务中心(阜新市疾病预防控制中心)8.123000,阜新市卫生健康服务中心(阜新市疾病预防控制中心)9.123000,阜新市卫生健康服务中心(阜新市疾病预防控制中心)
摘要:目的 对1例输入性HIV-l G亚型感染者病毒基因组进行序列测定,并进行系统进化分析.方法 采集在本地区艾滋病监测中发现的1例HIV-1 G亚型感染者的血清,提取病毒RNA,利用反转录巢式-PCR技术扩增并测定病毒近似全长基因序列.结果 获得此毒株近似全长基因组序列,长度为8695 bp.重组分析结果显示,此毒株序列中无其他亚型的基因型片段插入,为HIV-1 G亚型毒株;系统进化树显示,此毒株与尼日利亚流行株G.NG.1995.NG1937.AF069937亲缘关系最近,基因离散率为8.95%.此G亚型毒株以趋化性细胞因子受体5作为辅助受体,V3区有1个氨基酸缺失,糖蛋白GP120中有8个位点因多糖空洞而导致糖基化位点缺失.结论 本研究从分子流行病学角度证实该毒株为境外输入性毒株,此毒株序列的测定和分析对于本地区HIV流行趋势和HIV毒株多样性研究均具有重要意义,提示我们需加强艾滋病监测,防止境外毒株与本地毒株发生重组和流行.
关键词:HIV-1G亚型进化树基因测序
分类号:R512.91(传染病)
资助基金:艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治"科技重大专项(2017ZX10103007)
论文发表日期:2021-02-28
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 50-55 )
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传染病信息

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ISSN:1007-8134
年,卷(期):2021,34(1)
所属栏目:论著