生物信息学分析筛选畸形精子症氧化应激关键基因及候选中药材预测
杜超
侯开波
关小川
王博伦
吴莹
于月新
110000 沈阳,中国人民解放军北部战区总医院生殖医学科
摘要：目的:利用生物信息学分析筛选畸形精子症与氧化应激相关的差异表达基因(differentially expressed genes related to oxidative stress,OS-DEG)并进行候选中药材预测.方法:从 GEO(Gene Expression Omnibus)数据库查找GSE6969基因表达图谱,筛选差异表达基因后与GeneCards数据库中OS-DEG取交集,通过基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析以及蛋白质-蛋白质互作(protein-protein interaction,PPI)网络筛选关键通路和基因,在中医药百科全书数据库(The Encyclopedia of Traditional Chinese Medicine,ETCM)中查找关键基因的候选中药材药物.结果:通过差异分析共发现261个OS-DEG,利用Cytoscape筛选出PTEN、JUN、糖原合成酶激酶3β(glycogen synthase kinase 3β,GSK3β)、超氧化物歧化酶 2(superoxide dismutase 2,SOD2)等关键基因.预测的候选靶向中药材包括马齿苋、北沙参、半夏、马鞭草、丹参和白附子等.结论:可利用生物信息学分析筛选畸形精子症氧化应激相关的基因,为探讨中医药治疗畸形精子症提供新的见解.
关键词：畸形精子症氧化性应激基因中草药生物信息分析
资助基金：辽宁省科学技术计划项目(2024JH2/102600271)
论文发表日期：2025-09-15
在线出版日期：2025-10-30（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 361-365 )
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