仿刺参稚参体色变化时期转录组分析
边林鑫1
宋铭山2
杨晓龙3
张安国3
赵欢4
1.大连海洋大学海洋科技与环境学院,辽宁大连 116023;国家海洋环境监测中心,辽宁大连 1160232.宁波大学海洋学院,浙江宁波 3152113.国家海洋环境监测中心,辽宁大连 1160234.大连海洋大学海洋科技与环境学院,辽宁大连 116023
摘要:仿刺参(Apostichopus japonicus)是我国重要的海洋经济物种,在幼体发育过程中会经过体色变化阶段,作为仿刺参发育重要的阶段,目前有关报告集中于白色或紫色等特殊颜色仿刺参体色发生机理,而对于常见的青色仿刺参相关研究较少.本研究采集小白点(JW)、体色渐变(JV)和小黑点时期(JB)的青色稚参进行转录组测序,以期发掘青色仿刺参体色变化过程中的调控基因.测序结果共获得252 397个基因,差异分析发现,JW vs JB中差异基因数量最多,达到12 811个,JW vs JV中差异基因数量次之,为10 266个,JV vs JB中差异基因数量只有9 657个.GO和KEGG分析发现钙调蛋白、蛋白激酶C、类酪氨酸酶受体Cad96Ca及类酪氨酸酶等差异基因在青色稚参体色变化中存在差异表达,推测Ras信号通路、Wnt信号通路及MAPK信号通路等多个调控通路均参与青色稚参的黑色素合成过程.本研究为深入探究不同体色仿刺参色素沉着的分子机制的研究提供有价值的信息.
关键词:刺参稚参体色变化转录组差异表达基因
分类号:P735(海洋基础科学)
资助基金:国家自然科学基金(41676164)国家自然科学基金(41906115)南海海洋资源利用国家重点实验室开放课题(MRUKF2021008)辽宁省高等学校基本科研项目(LJ212410158026)辽宁省高等学校基本科研项目(2024JBYBZ003)
论文发表日期:2025-06-30
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:8( 65-72 )
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海洋湖沼通报

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CSTPCD北大核心CSCD
ISSN:1003-6482
年,卷(期):2025,47(3)
所属栏目:研究论文