利用ABEEM/MM模型对气态丝氨酸和苏氨酸残基二肽分子构象的研究
张霞1
张强1
杨忠志2
1.渤海大学,化学化工学院,辽宁,锦州,1210132.辽宁师范大学,化学化工学院,辽宁,大连,116029
摘要:应用ABEEM/MM浮动电荷模型(原子-键电负性均衡方法融合进分子力场)对气态丝氨酸和苏氨酸残基二肽分子构象进行了初步的研究,与经典的力场模型相比,该方法中的静电势包含了分子内和分子间的静电极化作用,以及分子内电荷转移影响,同时加入了化学键等非原子中心电荷位点,合理的体现了分子中的电荷分布.相对其他极化力场模型,该模型具有计算量较小的特点.结果表明:我们模型计算的两种二肽分子的构象能和关键二面角结褂氪油芳扑憬峁系煤芎?优于其他力场模型.
关键词:丝氨酸残基二肽苏氨酸残基二肽原子-键电负性均衡方法融合进分子力场(ABEEM/MM)构象极化力场
分类号:O6(化学)
资助基金:国家自然科学基金(20373021)
论文发表日期:2006-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 295-299 )
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