基于乳酸代谢基因的子宫内膜癌预后模型的构建与验证
张午洋
韦炜
蚌埠医科大学研究生院,安徽 蚌埠 233030;中国科学技术大学附属第一医院影像科,合肥 230001
摘要：目的 探讨基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,构建子宫内膜癌(EC)乳酸代谢相关基因预后风险模型,筛选关键生物标志物并验证其临床意义.方法 从TCGA项目中的子宫体子宫内膜癌(TCGA-UCEC)获取了35例正常子宫内膜组织和546例EC组织的转录组、临床及生存数据.将这546例癌症组织样本按1∶1比例随机分为训练集和验证集各273例.通过比较正常组织与训练队列中癌组织的转录组数据,鉴定出差异表达基因,并将其与分子信号数据库中的344个乳酸代谢相关基因取交集,将共有基因定义为后续分析的候选基因集.在此基础上,先通过单变量Cox回归分析初步筛选与预后相关的基因,再采用最小绝对收缩与选择算子(LASSO)-Cox回归进一步降维,构建出最终的风险评分模型.根据风险评分中位数将患者分为高危组与低危组,采用Wilcoxon秩和检验与卡方检验比较高危组与低危组间临床特征的差异,并通过Kaplan-Meier生存分析和Log-rank检验评估组间生存差异.此外,利用oncoPredict R包预测并比较高、低危组间对常用化疗药物的敏感性(以半数抑制浓度值衡量).结果 从TCGA-UCEC数据库中筛选出7 008个差异表达基因.进一步聚焦于乳酸代谢相关基因,通过单变量及LASSO-Cox回归分析,构建了一个包含溶质载体家族16成员1(SLC16A1)、GATA结合蛋白2(GATA2)和间变性淋巴瘤激酶(ALK)3个基因的预后风险模型.结果 显示高危组患者年龄更大、国际妇产科联盟分期更晚(均P<0.05).生存分析证实,与低危组患者相比,高危组患者的总生存期在训练集(P<0.001)和验证集(P=0.034)中均显著缩短.药物敏感性分析进一步提示,低危组对紫杉醇、多西他赛和环磷酰胺的敏感性更高(均P<0.05),而两组对铂类药物及拓扑替康敏感性的差异无统计学意义(P>0.05).结论 基于乳酸代谢相关基因构建的3基因(SLC16A1、GATA2和ALK)风险模型可有效预测EC预后,并为个性化治疗提供理论依据.
关键词：子宫内膜癌乳酸代谢预后模型药物敏感性生物信息学
资助基金：国家自然科学基金(82271991)
论文发表日期：2025-10-28
在线出版日期：2025-12-03（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 964-970 )
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