光滑念珠菌 Cdc42基因生物信息分析
赵静1
黄怀球1
袁立燕1
钟毅2
张静3
张晓辉4
1.中山大学附属第三医院皮肤性病科,广东 广州,5106302.广东省第二中医院,广东 广州,5100953.中山大学附属孙逸仙纪念医院皮肤性病科,广东 广州,5101204.广东省皮肤病医院,广东 广州,510091
摘要:目的:分析和预测光滑念珠菌Cdc42基因及其编码蛋白的结构和特性。方法:利用NCBI、Ex-PASy和CBS网站中的各种信息分析工具,并结合Vector NTI suite 8.0生物信息学分析软件包,分析预测光滑念珠菌Cdc42基因并预测该基因编码蛋白结构的特征和功能。结果:Cdc42基因全长为576 bp,编码区具有191个氨基酸,在GenBank同源序列中,其与酵母 Cdc42氨基酸序列一致性达到99%,且有Cdc42保守域。 Cdc42蛋白相对分子量预测为21420.83,理论等电点为6.31。预测Cdc42编码蛋白ɑ螺旋(H)、β折叠(E)、无规则卷(L)的比例分别是29.84%、28.70%、41.88%,1个GTP/ATP结合位点。 Cdc42蛋白为疏水蛋白,无跨膜区,无信号肽。结论:成功预测Cdc42基因及编码蛋白生化及结构特征,为下一步对其进行克隆和表达奠定基础。
关键词:光滑念珠菌细胞分裂周期蛋白(Cdc42)生物信息学
分类号:R756.5(皮肤病学与性病学)
资助基金:广东省自然科学基金(S2012020011056)
论文发表日期:2013-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:4( 234-237 )
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皮肤性病诊疗学杂志

皮肤性病诊疗学杂志

ISSN:1674-8468
年,卷(期):2013,(4)
所属栏目:论著