申克孢子丝菌chs1基因生物信息分析
孙瑶1
高文超1
何泰龙1
黄家敏1
黄丽林2
张静3
李美荣1
张云青1
尹颂超1
黄怀球1
1.中山大学附属第三医院皮肤科,广东广州,5106302.广东省妇幼保健院儿科,广东广州,5100103.中山大学附属第三医院皮肤科,广东广州510630;中山大学孙逸仙纪念医院皮肤科,广东广州510120
摘要：目的:对申克孢子丝菌几丁质合成酶基因(chs1)及其编码蛋白的结构和特性进行分析和预测.方法:利用NCBI网站、ExPASy和CBS等工具预测申克孢子丝菌chs1基因及编码蛋白的结构和功能.结果:chs1 mRNA全长2 745 bp,编码914个氨基酸.BLAST分析显示,申克孢子丝菌与巴西孢子丝菌、蓝菌属真菌、足马杜拉分枝菌等真菌chs氨基酸序列一致性达到99％,且有保守域.预测chs1蛋白相对分子量为102 714.7,理论等电点为6.71.预测chs1编码蛋白α螺旋、β折叠、β转角、无规则卷的比例分别是38.40％、17.94％、10.39％、33.26％.chs1蛋白是一种疏水蛋白,包含9个跨膜区,未发现信号肽.结论:成功预测了chs1基因及编码蛋白质的生化性质及结构特征,为下一步对其进行克隆、表达和敲除奠定基础.
关键词：申克孢子丝菌chs1基因生物信息学
分类号：R756(皮肤病学与性病学)
资助基金：国家自然科学基金(81371746)广东省科技计划(2013B010404013)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 238-242 )
英文信息