1株犬细小病毒的分型鉴定及VP2蛋白生物信息学分析
刘琪
赵福庆
韩彦飞
万玲
姚卫东
高锋
荀挚峰
辽宁农业职业技术学院,辽宁 营口 115009
摘要：研究旨在分析1株辽宁营口地区犬细小病毒(CPV)的亚型及其VP2蛋白的生物信息学特征.收集1例CPV感染的患犬粪便,提取病毒DNA,对CPV VP2基因进行PCR扩增及测序,比较VP2蛋白关键氨基酸位点确定CPV亚型,之后使用MegAlign和MEGA 6.0软件分析该CPV株VP2核苷酸的同源性及遗传进化情况,生物信息学软件分析CPV VP2蛋白理化性质、跨膜结构及高级结构等.结果显示:分离得到的CPV-LN1株VP2基因全长1 755 bp,编码584个氨基酸,属于CPV-2c亚型.CPV-LN1 VP2基因与参考毒株的CPV VP2基因的核苷酸同源性为98.9%～99.9%,与CPC-2c 855_CPV_HU株处于独立小分支.CPV-LN1 VP2蛋白为亲水性蛋白,无跨膜结构;含有6个潜在N-糖基化位点和53个磷酸化位点;主要分布于细胞质(43.5%)、细胞核(34.8%)和线粒体(21.7%);其二级结构α-螺旋、无规则卷曲、延伸链分别占4.62%、76.54%、18.84%;含有19个抗原决定簇.研究表明,CPV-LN1株属于CPV-2c亚型,其VP2蛋白为亲水性、非跨膜稳定蛋白,存在12个氨基酸数目≥7的抗原表位.
关键词：犬细小病毒基因分型遗传进化生物信息学
分类号：S852.65+9.2(动物医学（兽医学）)
资助基金：国家双高自筹-犬猫临床病例研究项目(0302368)辽宁省教育厅基本科研项目(LJ212510957002)辽宁省兴辽英才计划教学名师项目(XLYC2211015)辽宁农业职业技术学院校级课题(LnzkA202407)
论文发表日期：2026-02-15
在线出版日期：2026-03-16（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 20-25 )
英文信息