月季AP2/ERF基因家族鉴定分析
姜好1
杨陈玉1
王亚男2
郭涛2
张宏磊2
王锡敏2
李建伟2
王钧花2
姜涛2
1.扬州大学,江苏扬州 2250092.济南百合园林集团有限公司,山东济南 250004
摘要:月季(Rosa chinensis)是我国的十大名花之一.本研究以月季全基因组数据为基础,进行AP2/ERF基因家族的鉴定,并通过MEME、MEGA等生物信息学工具对AP2/ERF基因家族的理化性质、保守基序、基因结构、顺式作用元件、系统进化进行分析.共鉴定出169个AP2/ERF基因,定位在7条染色体上.根据理化性质分析显示,AP2/ERF蛋白氨基酸数量范围94~832aa,分子量范围10765.38~91007.8kD,等电点范围4.52~10.31,均为亲水性蛋白且大多数蛋白质定位于细胞外.根据系统发育分析结果,将这169个AP2/ERF基因划分为五个亚族.此研究筛选并系统分析了月季AP2/ERF基因,为进一步研究月季AP2/ERF基因功能提供了基础.
关键词:月季AP2/ERF家族生物信息学分析
分类号:S682.3(观赏园艺(花卉和观赏树林))
资助基金:科技创新合作项目(BHYLJY-KT-24-0102)
论文发表日期:2025-08-28
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:11( 8-18 )
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