帕金森病治疗潜在中药预测:从肠道微生物到铁死亡的双重见解
陈军磊1
丁图南2
孔维泰1
王维浩1
张振国1
李嘉怡1
赵钰沅1
李张恺1
郑洪博1
郭媛媛1
付强3
付殷3
1.黑龙江中医药大学第一临床医学院,黑龙江哈尔滨 1500062.北京中医药大学中医学院,北京 1024013.黑龙江中医药大学基础医学院,黑龙江哈尔滨 150040
摘要：目的 利用孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)探究帕金森病(Parkinson's disease,PD)与肠道微生物(intestinal flora,IF)的因果关联,预测调控IF干预PD的潜在中药及成分,从铁死亡视角解析其作用机制.方法 基于Mibiogen和IEU数据库的全基因组关联研究数据开展两样本MR分析.利用g:SNPense和Coremine数据库定位单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)邻近基因并预测中药,结合药典与教材规范中药分类.对预测靶标进行单细胞亚群表达分析.基于GEO数据集比较PD与铁死亡基因表达差异,加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选枢纽基因.从TCMSP和Herb数据库收集中药活性成分靶标,使用DrugnomeAI预测可药用性,对网药结果进行分子对接验证.结果 Candidatus Soleaferrea(OR,1.192;95％CI:1.041～1.366,P=0.011)、Clostridium sensu strictol(OR,1.356;95％CI:1.089～1.690,P=0.007)为 PD 风险菌群.潜在中药以寒、平性,甘、苦、辛味为主,多归心、肝、脾经,清热解毒类占比突出,其中合欢花、连翘、菝葜关联度较高.单细胞分析表明药靶在细胞亚群中表达存在差异.铁死亡相关基因FDFT1在PD中显著表达,WGCNA筛选出223个枢纽基因,与药物靶标交集18个,其中CYP2A6、MAP2K2等11个靶标可药用性良好,分子对接显示bicuculline-TOP1结合最优.结论 IF与铁死亡相关基因表达的关联提供了探索PD治疗新策略的双重视角,为PD治疗策略的创新提供了新的思路.
关键词：帕金森肠道微生物孟德尔随机化合欢花菝葜连翘网络药理学
分类号：R285(中药学)
资助基金：国家自然科学基金(No.81874426)中国博士后科学基金特别资助项目(No.2022T150069)大学生创新创业训练计划项目(No.202310228063)大学生创新创业训练计划项目(No.202310228031)北京中医药大学大学生创新创业训练计划项目(No.S202410026025)大学生创新创业训练计划项目(No.S202310228002)黑龙江中医药大学科技创新项目(No.KY2022-04)
论文发表日期：2025-09-30
在线出版日期：2025-10-30（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：12( 833-843,858 )
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