基于转录组分析的甘薯贮藏根淀粉含量相关SNPs开发
秦桢1
王庆美1
李爱贤1
周媛媛1
解备涛1
段文学1
张海燕1
李广华2
董顺旭1
侯夫云1
1.山东省农业科学院作物研究所/农业农村部黄淮海薯类科学观测站,山东 济南 2501002.泗水利丰食品有限公司,山东 泗水 273200
摘要：甘薯是重要的粮食和经济作物,贮藏根淀粉含量是甘薯的重要农艺性状,开发与淀粉含量相关的分子标记对于加快育种进程具有重要意义.但甘薯具有自交不亲和特性,基因组是高度杂合的六倍体,增加了开发分子标记的难度.本试验以高淀粉品种漯徐薯8号和低淀粉品种郑薯20及其杂交F1代中6个高淀粉株系和6个低淀粉株系为材料,基于转录组测序分析并结合表型分析,发现 44 个高淀粉特异的SNPs位点,从中选取 9个进行PCR单克隆分析,筛选到 3 个与高淀粉含量显著相关的位点,分别为chr9.27120209、chr9.27120256 和chr9.13675504,用上述 12 个株系和F1群体中的另外 16 个株系进行验证,最终得到 3 个与贮藏根淀粉含量相关的单核苷酸多态性(SNPs)位点.本试验丰富了甘薯分子标记开发的途径,为甘薯贮藏根淀粉含量相关育种提供了可选择的标记.
关键词：甘薯贮藏根淀粉含量单核苷酸多态性标记转录组分析
分类号：S531.01(薯类作物)
资助基金：山东省自然科学基金(ZR2024MC207)山东省重点研发计划项目(2021LZGC025)泰山产业领军人才工程项目(LJNY202113)国家甘薯产业技术体系项目(CARS-10-GW08)山东省薯类产业技术体系项目(SDAIT-16-04)
论文发表日期：2024-12-28
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 10-15 )
英文信息