番茄HD-Zip家族基因鉴定及非生物胁迫下HD-Zip Ⅲ亚家族基因的表达分析
张鑫1
郭旭东1
藏日娜1
张顺智1
朱文莹2
王富2
王辉2
1.青岛农业大学园艺学院,山东青岛 2661092.青岛农业大学园艺学院,山东青岛 266109;山东省园艺作物基因改良工程实验室,山东青岛 266109
摘要：为探究番茄HD-Zip家族成员的特征及HD-Zip Ⅲ亚家族成员在非生物胁迫响应中的作用,我们对番茄HD-Zip家族进行了全基因组鉴定与非生物胁迫下的表达分析.结果显示,从番茄中共筛选出56个HD-Zip家族基因,不均匀地分布在12条染色体上;这些基因被分成Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四个亚家族,同一亚家族的基因具有相似的理化性质、基因结构、保守基序和保守结构域.对番茄HD-Zip家族基因主要顺式作用元件的预测结果显示,MeJA响应元件出现的频率最高,MeJA能诱导防御性化合物的合成并启动与全身获得性抗性和局部抗性有关的发病机制相关基因的表达,推测这些基因可能在番茄抗逆性中发挥重要作用.共线性分析发现,番茄HD-Zip家族基因中有30个基因存在共线性,而番茄与拟南芥HD-Zip家族基因间有34对基因存在共线性.基因表达分析结果显示,HD-Zip Ⅲ亚家族基因均在番茄植株根中表达,而且对冷、盐、干旱、ABA等非生物胁迫均有响应,但不同基因受各胁迫诱导的表现不同,其中,Soly03g120910在冷胁迫下表达量显著提高,处理6 h时达到最高,与0 h相比上调了 10.3倍,同时该基因也受干旱胁迫诱导上调表达,处理6 h时的表达量与0 h相比提高了 1.6倍;Solyc11g069470对盐胁迫响应最强,处理3 h时表达量最高,与0 h相比上调1.0倍;Soly08g066500对ABA处理响应最强,处理6 h时的表达量与0 h相比上调了 5.4倍.本研究结果可为深入研究HD-Zip家族基因在植物逆境响应中的作用机制奠定基础.
关键词：番茄HD-Zip家族生物信息学分析基因表达非生物胁迫
分类号：S641.2(园艺)Q786(基因工程（遗传工程）)
资助基金：山东省重点研发计划(农业良种工程)项目(2022LZGC005)中央引导地方科技发展专项计划项目(23-1-3-2-zyyd-nsh)山东省蔬菜产业技术体系项目(SDAIT-05)山东省重点研发计划(重大科技创新工程)项目(2021LZGC018)
论文发表日期：2025-02-28
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：11( 11-21 )
英文信息