板栗2-ODD基因家族的鉴定及其在干旱胁迫下的表达分析
曾扬鹃1
杨涌1
郭江辉1
张海娥2
曹飞2
1.河北科技师范学院园艺科技学院,河北秦皇岛 066004;板栗产业技术教育部工程研究中心,河北秦皇岛 066004;河北省特色园艺种质挖掘与创新利用重点实验室,河北秦皇岛 0660042.板栗产业技术教育部工程研究中心,河北秦皇岛 066004;河北省特色园艺种质挖掘与创新利用重点实验室,河北秦皇岛 066004;河北省板栗产业协同创新中心,河北秦皇岛 066004
摘要：2-酮戊二酸依赖性双加氧酶(2-ODD)家族是植物中第二大酶家族,在调控植物对逆境的响应中具有重要作用.本研究利用生物信息学方法从板栗基因组中鉴定出123个Cm2-ODD基因家族成员,同时分析了它们的染色体分布、蛋白理化性质、保守基序、基因结构、共线性基因与顺式作用元件等以及在干旱胁迫下的表达情况.结果发现,Cm2-ODD家族蛋白都含有保守的2OG-Fe Ⅱ_Oxy结构域与保守的DIOX_N结构域,都为亲水性蛋白;Cm2-ODD基因家族成员大多拥有保守基序Motif 1—Motif 9,仅部分含有Motif 10,表明Cm2-ODD蛋白功能可能相对保守.共线性分析发现板栗基因组内Cm2-ODD基因家族可能正在受到纯化选择,2-ODD基因家族的大量复制可能发生在单、双子叶植物分化后.密码子偏好性分析显示Cm2-ODD基因家族偏好以A或U结尾.顺式作用元件分析结果显示,Cm2-ODD基因家族含有较多脱落酸和干旱响应元件,推测其功能可能与板栗抵御干旱胁迫相关;同时转录组分析证明干旱胁迫下Cm2-ODD基因家族有13个成员的表达量受到明显影响,其中Cm2-ODD19和Cm2-ODD16基因明显上调表达.
关键词：板栗Cm2-ODD基因家族生物信息学分析干旱胁迫基因表达
分类号：S664.2(果树园艺)Q781(基因工程（遗传工程）)
资助基金：国家重点研发计划(2022YFD2200400)教育部工程研究中心基金(PT2022-01)
论文发表日期：2025-04-30
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：13( 1-13 )
英文信息