基于重测序的开农系列花生品种(系)遗传多样性分析
郭敏杰1
邓丽1
苗建利1
雒峰2
殷君华1
孙宜根3
肖婷3
任丽1
1.开封市农林科学研究院,河南开封 4750042.河南省种业发展中心,河南郑州 4500003.开封市种业发展中心,河南开封 475004
摘要：本研究以0317组合(开农30×开选016)衍生的且推广面积较大的30份开农系列花生品种(系)为材料,基于二代全基因组重测序数据开展品种(系)间遗传相似性分析、群体结构分析和聚类分析,以为我国花生种质资源高效利用提供基础材料和可视化的技术参考.结果表明,质控后获得423 149个在染色体上分布均匀的高质量单核苷酸多态性(SNP)位点,其中3号染色体上的SNP位点最多,10号染色体上的最少,分别占总数的8.56％和2.66％.不同花生品种(系)间存在435个遗传相似性系数值,取值范围为0.55～0.96,平均值为0.73;开农301和开农306的遗传相似性系数最高(0.96),遗传关系最近;开农176和开农100的遗传相似性系数最低(0.55),遗传关系最远.群体结构分析将30份花生品种(系)分为3个亚群,分别占总数的30.00％、33.33％和36.67％,其中开农99和开农65的遗传背景相对复杂.聚类分析结果得出,30份花生品种(系)的群体遗传热图与进化树结果相吻合,30份花生品种(系)被划分为3个类群,结合系谱关系可知,同一组合育成品种(系)不一定聚在一起.综上,本研究中的30份花生品种(系)的遗传相似性较高,需拓宽遗传基础;花生优良品种选育过程中,可综合分析系谱和基于SNP的聚类分析结果进行种质资源筛选.
关键词：花生种质资源0317组合单核苷酸多态性遗传多样性
分类号：S565.2(经济作物)
资助基金：国家花生产业技术体系项目(CARS-13)河南省农业良种联合攻关项目(20220100001)开封市科技计划(22ZDYF008)
论文发表日期：2025-04-30
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 51-58 )
英文信息