高粱ABC基因家族鉴定及盐胁迫下的表达分析
陈增汀
王亚丽
张燕玲
孔颖
田皓韦
吴艳梅
隋娜
山东师范大学生命科学学院,山东济南 250000
摘要：ABC转运蛋白(ATP-binding cassette transporter,三磷酸腺苷结合盒转运蛋白)是植物中最大的转运蛋白家族之一,可以将代谢物质进行细胞跨膜运输,在植物生长发育以及抵御逆境过程中发挥重要作用.本研究对高粱ABC基因进行全基因组鉴定,最终筛选出135个SbABC基因.根据蛋白结构域将它们分为8个亚家族,按照染色体位置分别进行命名,并对它们的进化关系、基因结构、蛋白质基序、启动子顺式作用元件等进行预测分析,同时对它们在盐胁迫下的表达模式进行分析.结果表明,SbABC基因不均匀地分布在高粱10条染色体上,其中3号染色体上的ABC基因数量最多;通过构建系统进化树发现,高粱和拟南芥ABC基因的聚类关系与结构域分类保持一致;基序分析发现,有的基序在大部分ABC蛋白中存在,有的基序仅在特定亚族中存在,这可能与它们功能上的分化有关;ABC基因启动子含有脱落酸响应、逆境响应以及MYB识别位点等顺式作用元件,推测它们与高粱生长及胁迫响应有关.通过分析转录组数据发现,大部分SbABC基因在高粱根、茎和叶中均有表达.实时定量PCR(qRT-PCR)检测结果显示,在外源ABA(100 μmol/L)和NaCl(150 mmol/L)处理下,SbABCF3和SbABCG22基因均被显著诱导表达.本研究结果有助于了解ABC基因家族在高粱生长以及耐盐过程中的作用,为高粱耐盐机制研究以及耐盐作物培育提供了新的思路.
关键词：高粱ABC转运蛋白生物信息学分析盐胁迫表达分析
分类号：S514(禾谷类作物)Q781(基因工程（遗传工程）)
资助基金：国家重点研发计划(2022YFD1201702)
论文发表日期：2025-10-30
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：17( 1-17 )
英文信息