UPLC-Q-TOF-MS/MS联合生物信息学及网络药理学探讨仙方活命饮对脓毒症的治疗机制
王洁1
李苗苗1
齐雅囡1
周田1
王婷2
许雅倩1
刘成3
1.233000 安徽蚌埠,蚌埠医科大学第一附属医院重症医学科2.233040 安徽蚌埠,蚌埠市第一人民医院急诊医学科3.233000 安徽蚌埠,蚌埠医科大学第一附属医院重症医学科;233000 安徽蚌埠,蚌埠医科大学第一附属医院危重病研究所
摘要：目的 超高效液相色谱-四极杆飞行时间串联质谱(UPLC-Q-TOF-MS/MS)联合生物信息学及网络药理学探讨仙方活命饮对脓毒症的治疗机制.方法 使用UPLC-Q-TOF-MS/MS分析仙方活命饮的活性成分.将分析得到的活性成分以及通过文献检索的成分导入中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库筛选仙方活命饮的有效活性成分及潜在作用靶点.通过GEO数据库分析脓毒症差异表达基因.利用GeneCards、OMIM数据库筛选脓毒症的作用靶点.使用Venny工具筛取药物与疾病映射靶点,String数据库构建重合靶点的蛋白质相互作用(PPI)网络,导入Cytoscape软件建立药物-成分-靶点-疾病网络图,并筛选出核心作用靶点和关键成分.利用Metascape数据库分别进行KEGG通路和GO功能富集分析,依据P值筛选出相关性较高的信号通路.通过AutoDock、Pymol、Gromacs等软件对关键活性成分和核心作用靶点进行分子对接和分子动力学模拟,在分子层面进一步阐明关键成分与靶点结合的稳定性.结果 UPLC-Q-TOF-MS/MS分析得到39种化合物,将得到的化合物导入至TCMSP数据库,在"OB≥30％、DL≥0.18"条件下进一步筛选得到24种有效活性成分.获得177个仙方活命饮治疗脓毒症的潜在作用靶点.PPI网络分析依据degree值筛选出排名前五的核心靶点,分别是白细胞介素(IL)-6、肿瘤坏死因子(TNF)、信号转导与转录激活因子3(STAT3)、肿瘤抑制因子P53(TP53)、蛋白激酶B(AKT)1型.GO和KEGG富集分析显示,仙方活命饮在脓毒症治疗中涉及多条信号通路,主要包括丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、PI3K-Akt等.通过分子对接和分子动力学模拟,发现仙方活命饮中排名前四的核心成分槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇、柚皮素,与TP53、AKT1、STAT3、IL-6、TNF均具有较好的结合能力.结论 仙方活命饮具有"多成分、多靶点、多途径"的作用,槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇、柚皮素可能是仙方活命饮的主要活性成分,TP53、AKT1、STAT3、IL-6、TNF可能是仙方活命饮治疗脓毒症的潜在治疗靶点.仙方活命饮可能通过MAPK、PI3K-Akt等信号通路途径发挥治疗作用.
关键词：仙方活命饮生物信息学网络药理学分子对接分子动力学模拟脓毒症
资助基金：安徽省中医药学会中医药科研项目(2024ZYYXH156)安徽省高等学校自然科学类科学研究项目(2023AH051996)蚌埠医学院自然科学项目(2022byzd039)
论文发表日期：2025-09-10
在线出版日期：2025-10-17（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 752-760 )
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