GEPIA数据库在疾病基因表达分析中的应用介绍
陈新欢
耿辉
蒿花
姜红
马茂
西安交通大学第一附属医院健康医学科,西安 710061
摘要：近年来,随着大量分子生物学实验室的基因组测序数据不断产生,研究人员能够从分子角度诠释疾病的产生和发展,探索单基因或基因组在疾病中的表达水平,但基因所蕴含的序列特征、表达规律、基因间的相关性、代谢产物间的相互作用等非常复杂,导致研究人员理解基因在疾病中的关键作用时往往束手无策,基于基因表达水平值的交互式分析平台(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)数据库的诞生很好地解决了这一问题,该数据库以分析TCGA 和 GTEx 数据为主,通过检索基因在肿瘤样本中的表达量,分析基因在肿瘤产生发展中的作用,评估基因间的共表达水平,计算其与肿瘤预后的关系,通过该数据库,研究人员可一站式分析目标基因,为疾病的治疗靶点提供数据支撑,实现精准的疾病预后分类及诊断,填补肿瘤基因组学、治疗靶点的综合信息平台空缺,促进了广泛研究领域的生信信息学数据挖掘,为疾病临床治疗和诊断提供全新的视角.
关键词：GEPIA数据库基因表达分析肿瘤预后生物信息学
分类号：R394(医学遗传学)
资助基金：陕西省基金项目(2024SF-YBXM-097)西安交通大学第一附属医院院基金(2021ZYTS-39)
论文发表日期：2025-11-20
在线出版日期：2026-03-25（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 1287-1292 )
英文信息