GEO数据库分析环状RNA在乳腺癌组织中的表达
张鹤达1
李伟2
钟山亮3
姜林宏4
李建5
唐金海1
1.南京医科大学第一附属医院 普外科, 江苏 南京,2100292.东南大学 内分泌科, 江苏 南京,2100093.南京医科大学附属肿瘤医院 临床检验中心, 江苏 南京,2100094.徐州医科大学 研究生院, 江苏 徐州,2210045.南京医科大学附属肿瘤医院 普外科, 江苏 南京,210009
摘要：目的 采用生物信息学方法探究环状RNA在乳腺癌侵袭转移中的作用.方法 从GEO数据库中检索并下载乳腺癌组织的芯片数据,利用R软件对4对Luminal A型乳腺癌组织和4对三阴性乳腺癌组织进行差异分析,然后利用miRanda软件和RNAhybrid软件对差异表达的环状RNA和miRNAs之间的相互作用进行预测.通过TCGA数据库分析环状RNA的亲本基因在乳腺癌组织中的表达.结果 通过差异分析,发现共有27个环状RNA异常表达,其中6个环状RNA上调,21个环状RNA下调;通过软件预测构建了环状RNA/miRNAs相互作用网络;通过基因表达分析,hsa circ 0000965、hsa circ 0000523、hsa circ 0044234、hsa circ 0058451和hsa circ 0091994可能正向调控其亲本基因的表达.结论 在三阴性乳腺癌组织中的异常表达环状RNA将可能成为乳腺癌转移治疗的新靶点.
关键词：乳腺癌环状RNAmiRNA亲本基因
资助基金：国家重点研发计划(2016YFC0905900)国家自然科学基金(81872365)南京医科大学创新团队建设项目(JX102GSP201727)江苏省肿瘤医院院内项目(ZQ201508)
论文发表日期：2019-11-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 401-405 )
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