无绿藻PCR ITS1-ITS2基因分型法的建立及应用
赵悦1
朱巍巍2
刘锦燕2
孟玲宁3
王珏婷3
李文静3
项明洁1
1.上海交通大学医学院附属瑞金医院检验科,上海200025;上海交通大学医学院附属瑞金医院卢湾分院放免检验科,上海2000202.上海交通大学医学院附属瑞金医院卢湾分院放免检验科,上海,2000203.上海交通大学医学院附属瑞金医院检验科,上海,200025
摘要：目的 建立无绿藻(Prototheca) PCR ITS1-ITS2基因鉴定分型方法,并通过系统发育树以研究各型别无绿藻菌株间的亲缘关系.方法 抽提5株无绿藻临床分离菌株的DNA,通过特异性引物扩增ITS1及ITS2区后,根据该区域核苷酸片段的差异进行基因分型,借助MEGA6.0软件建立系统发育树,并通过SSU rDNA测序加以验证.结果 5株菌株中,1株鉴定为P.zopfii hydrocarbonea,2株鉴定为P.wickerhamii.虽然由于数据库中缺乏P.zopfii portoricensis菌株ITS序列导致1、2号菌株不能被鉴定,但ITS区系统发育树中这两株菌仍被归为P.zopfii中独立的一簇,与SSU rDNA系统发育树相近,证明此分型方法无误.结论 PCR ITS1-ITS2基因分型法可作为一种有效基因分型方法用于鉴定和监测无绿藻感染.
关键词：无绿藻无绿藻病基因型鉴定ITS区
分类号：R379.9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
资助基金：上海市黄浦区科技计划(HKW201545)上海市科委项目(15ZR1426900)上海市医学重点专科(ZK2012A21)上海市黄浦区优秀青年人才(RCPY1407)
论文发表日期：2018-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 4-7 )
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