单细胞转录组解析乳腺癌脑转移的免疫微环境异质性及预后特征预测
杨俊
刘东远
张东旭
林达
张洪兵
王浩
首都医科大学附属北京潞河医院神经外科,北京 101149
摘要：目的 本研究旨在揭示脑转移癌与原发性肿瘤在细胞和分子层面的差异,特别关注其免疫微环境及基因组变异,同时开发用于预测患者预后的模型.方法 研究采用单细胞RNA测序技术分析肿瘤样本,通过Scrublet识别双细胞,使用Scanpy整合数据,筛选高变异基因,并用Harmony算法校正批次效应.差异基因表达通过Wilcoxon秩和检验分析,拷贝数变异(CNV)使用infercnvpy推测.预后模型则基于Cox回归和LASSO回归方法开发.结果 研究发现,脑转移癌具有更高的肿瘤细胞比例和更少的免疫细胞,表现出免疫抑制性微环境.髓系细胞偏向脂质代谢型巨噬细胞,树突状细胞减少,表明抗原呈递功能下降.自然杀伤细胞和T细胞稀少,进一步支持免疫抑制特征.CNV分析显示脑转移癌的基因组变异增加,并与细胞周期失调相关.研究还识别出与患者生存显著相关的基因,如PLTP、CP和ADGRG6,这些基因具有潜在的预后标志物作用.结论 本研究揭示了脑转移癌独特的免疫抑制环境和基因组复杂性,开发的预后模型具有潜在临床应用价值.未来的治疗研究应重点探索靶向这些通路的策略,以改善患者预后.
关键词：脑转移癌单细胞转录组基因组变异免疫微环境预后
论文发表日期：2025-12-28
在线出版日期：2025-12-02（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 52-58 )
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